农村有两个男孩的家庭，可以申请宅基地，但原则上是一处。从法律角度看，《中华人民共和国土地管理法》第六十二条规定，农村村民一户只能拥有一处宅基地。因此，农村有两个男孩的家庭在原则上只能申请一处宅基地。但如果两个男孩均已成年并独立成家，满足分户条件且确实缺少宅基地，他们可以通过分户的方式分别申请宅基地。问题严重时，如出现宅基地申请被非法拒绝或宅基地权益受到侵害且无法协商解决时，应及时寻求法律专业人士的帮助。
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从法律角度，农村有两个男孩的家庭申请宅基地在不同情况下的具体处理方式如下：1.若两个男孩未成年且与父母同住，则家庭作为一户只能申请一处宅基地，此时应共享一处宅基地，待孩子成年且满足分户条件后再考虑申请新的宅基地。2.若其中一个男孩已成年并独立成家，且满足分户和申请宅基地的条件，则他可以通过分户的方式申请新的宅基地。此时，应准备好分户和申请宅基地的相关材料，并按照规定的流程向村委会、乡镇政府和县级政府提交申请。3.若两个男孩均已成年并独立成家，且都满足分户和申请宅基地的条件，则他们都可以分别申请宅基地。但需要注意的是，每个家庭（即每个已分户的男孩及其家庭）仍然只能拥有一处宅基地。此时，两个家庭应分别准备申请材料，并按照规定的流程分别提交申请。在处理宅基地申请时，务必确保遵守当地的法律法规和政策要求，确保申请材料的真实性和完整性，以避免因违规操作而导致的申请失败或法律纠纷。
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从法律角度讲，农村宅基地申请常见的处理方式包括了解政策、准备材料、提交申请和逐级审批。选择不同处理方式时，应首先确保了解当地的宅基地申请政策和规定，然后按照要求准备齐全的申请材料，并按照规定的流程向相关部门提交申请。在申请过程中，要保持与相关部门的沟通，及时了解申请进度和结果。