分居从夫妻双方因感情不和不再同居生活的第二个自然日开始计算。按照《中华人民共和国民法典》的规定，连续分居满两年是准予离婚的重要条件之一。如果期间有短暂的同居行为，分居时间应重新计算。确保准确计算分居时间对离婚诉讼结果至关重要。
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分居时间的计算一般依据两种常见方法：一是从夫妻实际分居且连续计算；二是在分居期间如果有复合再分居的情况，则从新的分居行为开始重新计算时间。具体采用哪种方法需视实际情况和相关证据而定。若可证明连续分居已满两年，则可选择第一种方式计算。
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分居时间的起始点是夫妻因感情不和不再同居生活的第二天算起。在分居期间，如果夫妻出现了复合行为，那么分居时间应重新开始计算。对于离婚诉讼，要确保有充分的证据来证明已经连续分居满两年或其他符合的离婚条件。如果不准确计算分居时间或缺乏证据，可能会对离婚请求的判决产生影响。因此，处理分居问题时建议咨询专业律师并妥善保存相关证据。